Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CLTCQ00610 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CLTCQ00610 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CLTCQ00610 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CLTCQ00610 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
CLTCQ00610 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CLTCQ00610 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CLTCQ00610 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CLTCQ00610 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CLTCQ00610 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CLTCQ00610 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CLTCQ00610 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CLTCQ00610 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
CLTCQ00610 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CLTCQ00610 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CLTCQ00610 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CLTCQ00610 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CLTCQ00610 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CLTCQ00610 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CLTCQ00610 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CLTCQ00610 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CLTCQ00610 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
CLTCQ00610 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
CLTCQ00610 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CLTCQ00610 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CLTCQ00610 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CLTCQ00610 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
CLTCQ00610 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CLTCQ00610 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CLTCQ00610 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CLTCQ00610 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CLTCQ00610 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CLTCQ00610 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CLTCQ00610 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CLTCQ00610 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
CLTCQ00610 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
CLTCQ00610 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CLTCQ00610 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CLTCQ00610 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
CLTCQ00610 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CLTCQ00610 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CLTCQ00610 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CLTCQ00610 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
CLTCQ00610 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CLTCQ00610 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
CLTCQ00610 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CLTCQ00610 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
CLTCQ00610 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CLTCQ00610 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CLTCQ00610 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CLTCQ00610 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
CLTCQ00610 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
CLTCQ00610 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CLTCQ00610 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CLTCQ00610 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CLTCQ00610 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CLTCQ00610 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms