Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
FGD1P98174 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FGD1P98174 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FGD1P98174 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FGD1P98174 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
FGD1P98174 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FGD1P98174 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FGD1P98174 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FGD1P98174 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FGD1P98174 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FGD1P98174 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
FGD1P98174 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FGD1P98174 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FGD1P98174 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FGD1P98174 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FGD1P98174 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
FGD1P98174 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FGD1P98174 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FGD1P98174 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FGD1P98174 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FGD1P98174 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FGD1P98174 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FGD1P98174 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FGD1P98174 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FGD1P98174 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FGD1P98174 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FGD1P98174 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FGD1P98174 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FGD1P98174 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FGD1P98174 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FGD1P98174 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FGD1P98174 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FGD1P98174 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
FGD1P98174 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
FGD1P98174 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FGD1P98174 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FGD1P98174 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FGD1P98174 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FGD1P98174 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FGD1P98174 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
FGD1P98174 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
FGD1P98174 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FGD1P98174 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FGD1P98174 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FGD1P98174 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGD1P98174 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGD1P98174 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FGD1P98174 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FGD1P98174 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FGD1P98174 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FGD1P98174 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FGD1P98174 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FGD1P98174 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FGD1P98174 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
FGD1P98174 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FGD1P98174 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGD1P98174 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGD1P98174 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGD1P98174 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGD1P98174 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGD1P98174 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
FGD1P98174 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGD1P98174 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGD1P98174 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGD1P98174 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGD1P98174 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
FGD1P98174 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGD1P98174 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGD1P98174 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FGD1P98174 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGD1P98174 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGD1P98174 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGD1P98174 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGD1P98174 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
FGD1P98174 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGD1P98174 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
FGD1P98174 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FGD1P98174 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FGD1P98174 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FGD1P98174 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FGD1P98174 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FGD1P98174 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FGD1P98174 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FGD1P98174 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGD1P98174 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGD1P98174 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGD1P98174 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGD1P98174 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGD1P98174 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGD1P98174 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FGD1P98174 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGD1P98174 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGD1P98174 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGD1P98174 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGD1P98174 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGD1P98174 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGD1P98174 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGD1P98174 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
FGD1P98174 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FGD1P98174 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.6 ms