Protein–RNA interactions for Protein: P78406

RAE1, mRNA export factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAE1P78406 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAE1P78406 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAE1P78406 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAE1P78406 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RAE1P78406 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAE1P78406 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAE1P78406 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAE1P78406 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAE1P78406 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAE1P78406 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAE1P78406 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAE1P78406 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAE1P78406 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAE1P78406 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAE1P78406 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAE1P78406 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAE1P78406 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAE1P78406 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RAE1P78406 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAE1P78406 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAE1P78406 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAE1P78406 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAE1P78406 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAE1P78406 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAE1P78406 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAE1P78406 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAE1P78406 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAE1P78406 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAE1P78406 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAE1P78406 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAE1P78406 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAE1P78406 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAE1P78406 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAE1P78406 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAE1P78406 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAE1P78406 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAE1P78406 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAE1P78406 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAE1P78406 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAE1P78406 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAE1P78406 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAE1P78406 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAE1P78406 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAE1P78406 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAE1P78406 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAE1P78406 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAE1P78406 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAE1P78406 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAE1P78406 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAE1P78406 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAE1P78406 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAE1P78406 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAE1P78406 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAE1P78406 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAE1P78406 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAE1P78406 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAE1P78406 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAE1P78406 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAE1P78406 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAE1P78406 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAE1P78406 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAE1P78406 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAE1P78406 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAE1P78406 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAE1P78406 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAE1P78406 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAE1P78406 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAE1P78406 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAE1P78406 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAE1P78406 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAE1P78406 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAE1P78406 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAE1P78406 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAE1P78406 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAE1P78406 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAE1P78406 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAE1P78406 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAE1P78406 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAE1P78406 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAE1P78406 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAE1P78406 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAE1P78406 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAE1P78406 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAE1P78406 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAE1P78406 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAE1P78406 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAE1P78406 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAE1P78406 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAE1P78406 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAE1P78406 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAE1P78406 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAE1P78406 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAE1P78406 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAE1P78406 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAE1P78406 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAE1P78406 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAE1P78406 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RAE1P78406 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAE1P78406 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAE1P78406 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms