Protein–RNA interactions for Protein: P62851

RPS25, 40S ribosomal protein S25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS25P62851 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS25P62851 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS25P62851 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS25P62851 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS25P62851 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS25P62851 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS25P62851 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS25P62851 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS25P62851 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS25P62851 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS25P62851 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS25P62851 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS25P62851 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS25P62851 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RPS25P62851 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPS25P62851 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPS25P62851 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPS25P62851 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPS25P62851 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPS25P62851 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RPS25P62851 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPS25P62851 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPS25P62851 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPS25P62851 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPS25P62851 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RPS25P62851 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RPS25P62851 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS25P62851 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS25P62851 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS25P62851 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS25P62851 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS25P62851 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS25P62851 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS25P62851 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS25P62851 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS25P62851 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RPS25P62851 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RPS25P62851 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS25P62851 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS25P62851 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS25P62851 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS25P62851 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS25P62851 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RPS25P62851 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS25P62851 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS25P62851 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS25P62851 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS25P62851 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS25P62851 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS25P62851 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS25P62851 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS25P62851 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS25P62851 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS25P62851 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS25P62851 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS25P62851 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RPS25P62851 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS25P62851 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS25P62851 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS25P62851 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS25P62851 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS25P62851 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS25P62851 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS25P62851 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS25P62851 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS25P62851 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS25P62851 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS25P62851 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RPS25P62851 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS25P62851 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS25P62851 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS25P62851 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS25P62851 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS25P62851 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS25P62851 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS25P62851 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RPS25P62851 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS25P62851 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS25P62851 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS25P62851 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS25P62851 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS25P62851 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS25P62851 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS25P62851 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS25P62851 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS25P62851 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS25P62851 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS25P62851 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS25P62851 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS25P62851 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS25P62851 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS25P62851 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPS25P62851 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS25P62851 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS25P62851 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS25P62851 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS25P62851 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS25P62851 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS25P62851 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPS25P62851 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.4 ms