Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR2FP61218 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2FP61218 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR2FP61218 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR2FP61218 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR2FP61218 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR2FP61218 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR2FP61218 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR2FP61218 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR2FP61218 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR2FP61218 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2FP61218 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2FP61218 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2FP61218 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2FP61218 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2FP61218 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2FP61218 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR2FP61218 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR2FP61218 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR2FP61218 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR2FP61218 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2FP61218 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2FP61218 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2FP61218 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2FP61218 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms