Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
LINC00205P59089 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
LINC00205P59089 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
LINC00205P59089 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms