Protein–RNA interactions for Protein: P57071

PRDM15, PR domain zinc finger protein 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM15P57071 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PRDM15P57071 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PRDM15P57071 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
PRDM15P57071 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
PRDM15P57071 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PRDM15P57071 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PRDM15P57071 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PRDM15P57071 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PRDM15P57071 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PRDM15P57071 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PRDM15P57071 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PRDM15P57071 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PRDM15P57071 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
PRDM15P57071 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PRDM15P57071 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PRDM15P57071 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PRDM15P57071 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PRDM15P57071 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PRDM15P57071 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PRDM15P57071 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
PRDM15P57071 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
PRDM15P57071 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PRDM15P57071 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PRDM15P57071 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PRDM15P57071 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PRDM15P57071 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PRDM15P57071 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PRDM15P57071 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PRDM15P57071 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PRDM15P57071 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PRDM15P57071 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PRDM15P57071 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PRDM15P57071 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
PRDM15P57071 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PRDM15P57071 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PRDM15P57071 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PRDM15P57071 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PRDM15P57071 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PRDM15P57071 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PRDM15P57071 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PRDM15P57071 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PRDM15P57071 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PRDM15P57071 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PRDM15P57071 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PRDM15P57071 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PRDM15P57071 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
PRDM15P57071 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PRDM15P57071 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PRDM15P57071 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PRDM15P57071 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PRDM15P57071 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PRDM15P57071 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PRDM15P57071 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PRDM15P57071 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
PRDM15P57071 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PRDM15P57071 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PRDM15P57071 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
PRDM15P57071 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PRDM15P57071 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PRDM15P57071 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PRDM15P57071 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PRDM15P57071 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PRDM15P57071 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PRDM15P57071 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PRDM15P57071 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PRDM15P57071 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PRDM15P57071 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PRDM15P57071 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PRDM15P57071 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PRDM15P57071 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PRDM15P57071 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PRDM15P57071 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PRDM15P57071 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC34.34■■■■□ 3.09
PRDM15P57071 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PRDM15P57071 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PRDM15P57071 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PRDM15P57071 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PRDM15P57071 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
PRDM15P57071 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PRDM15P57071 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PRDM15P57071 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PRDM15P57071 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PRDM15P57071 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PRDM15P57071 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PRDM15P57071 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PRDM15P57071 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PRDM15P57071 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PRDM15P57071 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PRDM15P57071 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PRDM15P57071 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PRDM15P57071 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PRDM15P57071 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PRDM15P57071 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PRDM15P57071 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
PRDM15P57071 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PRDM15P57071 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PRDM15P57071 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PRDM15P57071 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
PRDM15P57071 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PRDM15P57071 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.3 ms