Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SIK1P57059 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SIK1P57059 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SIK1P57059 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
SIK1P57059 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SIK1P57059 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SIK1P57059 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
SIK1P57059 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SIK1P57059 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SIK1P57059 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
SIK1P57059 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
SIK1P57059 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
SIK1P57059 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
SIK1P57059 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SIK1P57059 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
SIK1P57059 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
SIK1P57059 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SIK1P57059 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SIK1P57059 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SIK1P57059 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SIK1P57059 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SIK1P57059 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SIK1P57059 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
SIK1P57059 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
SIK1P57059 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SIK1P57059 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SIK1P57059 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SIK1P57059 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SIK1P57059 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
SIK1P57059 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SIK1P57059 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
SIK1P57059 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SIK1P57059 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
SIK1P57059 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SIK1P57059 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SIK1P57059 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SIK1P57059 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SIK1P57059 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
SIK1P57059 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
SIK1P57059 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
SIK1P57059 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SIK1P57059 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SIK1P57059 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
SIK1P57059 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SIK1P57059 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SIK1P57059 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SIK1P57059 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SIK1P57059 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
SIK1P57059 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
SIK1P57059 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SIK1P57059 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SIK1P57059 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SIK1P57059 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SIK1P57059 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SIK1P57059 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SIK1P57059 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
SIK1P57059 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SIK1P57059 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SIK1P57059 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SIK1P57059 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SIK1P57059 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SIK1P57059 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SIK1P57059 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
SIK1P57059 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SIK1P57059 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SIK1P57059 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SIK1P57059 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
SIK1P57059 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SIK1P57059 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SIK1P57059 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SIK1P57059 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SIK1P57059 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SIK1P57059 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SIK1P57059 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SIK1P57059 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SIK1P57059 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SIK1P57059 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SIK1P57059 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SIK1P57059 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SIK1P57059 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SIK1P57059 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SIK1P57059 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SIK1P57059 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SIK1P57059 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SIK1P57059 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
SIK1P57059 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SIK1P57059 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SIK1P57059 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SIK1P57059 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SIK1P57059 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SIK1P57059 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SIK1P57059 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
SIK1P57059 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SIK1P57059 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SIK1P57059 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
SIK1P57059 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SIK1P57059 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SIK1P57059 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SIK1P57059 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SIK1P57059 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.1 ms