Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
GPC3P51654 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPC3P51654 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPC3P51654 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPC3P51654 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPC3P51654 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPC3P51654 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GPC3P51654 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPC3P51654 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GPC3P51654 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPC3P51654 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPC3P51654 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPC3P51654 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPC3P51654 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GPC3P51654 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GPC3P51654 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GPC3P51654 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GPC3P51654 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GPC3P51654 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPC3P51654 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GPC3P51654 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GPC3P51654 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GPC3P51654 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPC3P51654 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPC3P51654 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPC3P51654 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPC3P51654 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPC3P51654 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GPC3P51654 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GPC3P51654 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GPC3P51654 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
GPC3P51654 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPC3P51654 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPC3P51654 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPC3P51654 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPC3P51654 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPC3P51654 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPC3P51654 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPC3P51654 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPC3P51654 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPC3P51654 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPC3P51654 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPC3P51654 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPC3P51654 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPC3P51654 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPC3P51654 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GPC3P51654 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPC3P51654 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPC3P51654 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPC3P51654 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GPC3P51654 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GPC3P51654 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPC3P51654 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPC3P51654 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPC3P51654 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPC3P51654 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPC3P51654 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPC3P51654 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPC3P51654 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPC3P51654 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPC3P51654 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPC3P51654 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPC3P51654 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPC3P51654 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPC3P51654 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPC3P51654 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPC3P51654 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPC3P51654 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPC3P51654 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GPC3P51654 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC3P51654 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC3P51654 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC3P51654 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC3P51654 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC3P51654 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC3P51654 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC3P51654 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC3P51654 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC3P51654 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC3P51654 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC3P51654 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC3P51654 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GPC3P51654 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GPC3P51654 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPC3P51654 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPC3P51654 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GPC3P51654 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPC3P51654 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GPC3P51654 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPC3P51654 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPC3P51654 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPC3P51654 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPC3P51654 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPC3P51654 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPC3P51654 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPC3P51654 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPC3P51654 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPC3P51654 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPC3P51654 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPC3P51654 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms