Protein–RNA interactions for Protein: P36955

SERPINF1, Pigment epithelium-derived factor, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINF1P36955 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SERPINF1P36955 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SERPINF1P36955 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SERPINF1P36955 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms