Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHI3L1P36222 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CHI3L1P36222 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms