Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ABCC1P33527 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ABCC1P33527 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ABCC1P33527 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
ABCC1P33527 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
ABCC1P33527 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
ABCC1P33527 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
ABCC1P33527 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ABCC1P33527 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ABCC1P33527 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
ABCC1P33527 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
ABCC1P33527 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
ABCC1P33527 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
ABCC1P33527 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
ABCC1P33527 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
ABCC1P33527 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ABCC1P33527 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ABCC1P33527 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ABCC1P33527 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
ABCC1P33527 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
ABCC1P33527 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ABCC1P33527 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ABCC1P33527 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ABCC1P33527 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ABCC1P33527 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
ABCC1P33527 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ABCC1P33527 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
ABCC1P33527 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ABCC1P33527 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
ABCC1P33527 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ABCC1P33527 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
ABCC1P33527 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ABCC1P33527 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
ABCC1P33527 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ABCC1P33527 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
ABCC1P33527 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ABCC1P33527 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
ABCC1P33527 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC35.41■■■■□ 3.26
ABCC1P33527 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ABCC1P33527 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
ABCC1P33527 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
ABCC1P33527 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ABCC1P33527 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ABCC1P33527 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
ABCC1P33527 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ABCC1P33527 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ABCC1P33527 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
ABCC1P33527 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
ABCC1P33527 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
ABCC1P33527 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ABCC1P33527 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ABCC1P33527 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ABCC1P33527 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ABCC1P33527 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
ABCC1P33527 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
ABCC1P33527 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC35.37■■■■□ 3.25
ABCC1P33527 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
ABCC1P33527 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ABCC1P33527 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ABCC1P33527 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
ABCC1P33527 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
ABCC1P33527 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
ABCC1P33527 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ABCC1P33527 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
ABCC1P33527 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
ABCC1P33527 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
ABCC1P33527 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
ABCC1P33527 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
ABCC1P33527 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
ABCC1P33527 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ABCC1P33527 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ABCC1P33527 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
ABCC1P33527 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
ABCC1P33527 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ABCC1P33527 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC35.34■■■■□ 3.25
ABCC1P33527 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
ABCC1P33527 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ABCC1P33527 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ABCC1P33527 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ABCC1P33527 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ABCC1P33527 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ABCC1P33527 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
ABCC1P33527 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
ABCC1P33527 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
ABCC1P33527 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
ABCC1P33527 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.25
ABCC1P33527 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ABCC1P33527 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ABCC1P33527 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
ABCC1P33527 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ABCC1P33527 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ABCC1P33527 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
ABCC1P33527 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
ABCC1P33527 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
ABCC1P33527 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
ABCC1P33527 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
ABCC1P33527 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
ABCC1P33527 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ABCC1P33527 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
ABCC1P33527 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms