Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CA4P22748 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CA4P22748 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CA4P22748 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CA4P22748 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CA4P22748 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CA4P22748 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CA4P22748 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CA4P22748 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CA4P22748 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CA4P22748 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CA4P22748 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CA4P22748 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CA4P22748 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CA4P22748 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CA4P22748 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CA4P22748 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CA4P22748 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CA4P22748 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CA4P22748 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CA4P22748 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CA4P22748 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CA4P22748 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CA4P22748 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CA4P22748 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CA4P22748 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CA4P22748 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CA4P22748 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CA4P22748 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CA4P22748 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CA4P22748 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CA4P22748 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CA4P22748 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CA4P22748 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CA4P22748 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CA4P22748 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CA4P22748 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CA4P22748 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CA4P22748 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CA4P22748 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CA4P22748 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CA4P22748 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CA4P22748 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CA4P22748 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CA4P22748 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CA4P22748 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CA4P22748 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CA4P22748 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CA4P22748 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CA4P22748 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CA4P22748 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CA4P22748 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CA4P22748 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CA4P22748 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CA4P22748 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CA4P22748 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CA4P22748 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CA4P22748 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CA4P22748 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CA4P22748 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CA4P22748 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CA4P22748 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CA4P22748 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CA4P22748 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CA4P22748 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CA4P22748 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CA4P22748 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CA4P22748 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CA4P22748 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CA4P22748 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CA4P22748 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CA4P22748 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CA4P22748 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CA4P22748 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CA4P22748 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CA4P22748 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CA4P22748 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CA4P22748 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CA4P22748 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CA4P22748 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CA4P22748 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CA4P22748 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CA4P22748 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CA4P22748 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CA4P22748 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CA4P22748 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CA4P22748 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CA4P22748 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CA4P22748 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CA4P22748 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CA4P22748 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CA4P22748 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CA4P22748 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CA4P22748 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CA4P22748 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CA4P22748 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CA4P22748 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CA4P22748 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CA4P22748 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CA4P22748 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms