Protein–RNA interactions for Protein: P21108

PRPS1L1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1L1P21108 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPS1L1P21108 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPS1L1P21108 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPS1L1P21108 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms