Protein–RNA interactions for Protein: P19793

RXRA, Retinoic acid receptor RXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRAP19793 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
RXRAP19793 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RXRAP19793 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RXRAP19793 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RXRAP19793 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RXRAP19793 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RXRAP19793 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
RXRAP19793 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RXRAP19793 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RXRAP19793 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RXRAP19793 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RXRAP19793 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RXRAP19793 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RXRAP19793 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RXRAP19793 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RXRAP19793 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RXRAP19793 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RXRAP19793 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RXRAP19793 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RXRAP19793 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RXRAP19793 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RXRAP19793 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RXRAP19793 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RXRAP19793 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RXRAP19793 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RXRAP19793 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RXRAP19793 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RXRAP19793 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RXRAP19793 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RXRAP19793 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RXRAP19793 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RXRAP19793 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RXRAP19793 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RXRAP19793 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RXRAP19793 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RXRAP19793 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RXRAP19793 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RXRAP19793 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RXRAP19793 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RXRAP19793 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RXRAP19793 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RXRAP19793 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RXRAP19793 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RXRAP19793 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RXRAP19793 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RXRAP19793 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RXRAP19793 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RXRAP19793 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
RXRAP19793 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RXRAP19793 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RXRAP19793 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RXRAP19793 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RXRAP19793 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RXRAP19793 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RXRAP19793 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RXRAP19793 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RXRAP19793 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RXRAP19793 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RXRAP19793 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RXRAP19793 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RXRAP19793 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RXRAP19793 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RXRAP19793 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RXRAP19793 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RXRAP19793 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RXRAP19793 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RXRAP19793 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RXRAP19793 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RXRAP19793 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RXRAP19793 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RXRAP19793 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RXRAP19793 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RXRAP19793 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RXRAP19793 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RXRAP19793 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RXRAP19793 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RXRAP19793 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RXRAP19793 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RXRAP19793 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RXRAP19793 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RXRAP19793 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RXRAP19793 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RXRAP19793 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RXRAP19793 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RXRAP19793 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RXRAP19793 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RXRAP19793 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RXRAP19793 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RXRAP19793 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RXRAP19793 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RXRAP19793 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RXRAP19793 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RXRAP19793 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RXRAP19793 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RXRAP19793 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RXRAP19793 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RXRAP19793 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RXRAP19793 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RXRAP19793 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RXRAP19793 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 657.7 ms