Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NELFEP18615 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NELFEP18615 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NELFEP18615 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NELFEP18615 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NELFEP18615 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
NELFEP18615 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
NELFEP18615 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NELFEP18615 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NELFEP18615 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NELFEP18615 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NELFEP18615 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NELFEP18615 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NELFEP18615 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NELFEP18615 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NELFEP18615 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NELFEP18615 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NELFEP18615 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NELFEP18615 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NELFEP18615 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NELFEP18615 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NELFEP18615 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NELFEP18615 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NELFEP18615 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NELFEP18615 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NELFEP18615 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NELFEP18615 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NELFEP18615 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NELFEP18615 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NELFEP18615 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NELFEP18615 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NELFEP18615 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NELFEP18615 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NELFEP18615 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NELFEP18615 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NELFEP18615 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NELFEP18615 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NELFEP18615 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NELFEP18615 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NELFEP18615 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
NELFEP18615 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NELFEP18615 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NELFEP18615 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NELFEP18615 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NELFEP18615 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NELFEP18615 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NELFEP18615 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NELFEP18615 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NELFEP18615 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NELFEP18615 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NELFEP18615 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NELFEP18615 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NELFEP18615 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NELFEP18615 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NELFEP18615 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NELFEP18615 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NELFEP18615 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NELFEP18615 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NELFEP18615 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NELFEP18615 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NELFEP18615 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NELFEP18615 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NELFEP18615 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NELFEP18615 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NELFEP18615 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NELFEP18615 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NELFEP18615 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NELFEP18615 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NELFEP18615 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NELFEP18615 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NELFEP18615 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NELFEP18615 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NELFEP18615 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NELFEP18615 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NELFEP18615 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NELFEP18615 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NELFEP18615 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NELFEP18615 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NELFEP18615 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NELFEP18615 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NELFEP18615 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NELFEP18615 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NELFEP18615 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NELFEP18615 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NELFEP18615 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NELFEP18615 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NELFEP18615 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NELFEP18615 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NELFEP18615 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NELFEP18615 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NELFEP18615 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NELFEP18615 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NELFEP18615 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NELFEP18615 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NELFEP18615 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NELFEP18615 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NELFEP18615 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NELFEP18615 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NELFEP18615 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NELFEP18615 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms