Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CREB1P16220 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CREB1P16220 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CREB1P16220 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CREB1P16220 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CREB1P16220 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CREB1P16220 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CREB1P16220 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CREB1P16220 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CREB1P16220 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CREB1P16220 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CREB1P16220 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CREB1P16220 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CREB1P16220 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CREB1P16220 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB1P16220 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB1P16220 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB1P16220 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB1P16220 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB1P16220 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB1P16220 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB1P16220 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB1P16220 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB1P16220 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CREB1P16220 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB1P16220 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB1P16220 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB1P16220 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB1P16220 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB1P16220 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB1P16220 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB1P16220 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB1P16220 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB1P16220 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB1P16220 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB1P16220 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB1P16220 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CREB1P16220 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CREB1P16220 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CREB1P16220 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CREB1P16220 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CREB1P16220 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CREB1P16220 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CREB1P16220 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CREB1P16220 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CREB1P16220 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CREB1P16220 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CREB1P16220 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CREB1P16220 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CREB1P16220 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CREB1P16220 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CREB1P16220 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CREB1P16220 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CREB1P16220 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB1P16220 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB1P16220 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB1P16220 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB1P16220 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB1P16220 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB1P16220 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB1P16220 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB1P16220 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CREB1P16220 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB1P16220 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB1P16220 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB1P16220 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB1P16220 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB1P16220 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB1P16220 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB1P16220 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB1P16220 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB1P16220 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CREB1P16220 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREB1P16220 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREB1P16220 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREB1P16220 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREB1P16220 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREB1P16220 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREB1P16220 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREB1P16220 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREB1P16220 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREB1P16220 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREB1P16220 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREB1P16220 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CREB1P16220 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB1P16220 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB1P16220 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB1P16220 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB1P16220 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB1P16220 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB1P16220 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB1P16220 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB1P16220 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CREB1P16220 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB1P16220 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB1P16220 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB1P16220 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB1P16220 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB1P16220 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CREB1P16220 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms