Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ZNF35P13682 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ZNF35P13682 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ZNF35P13682 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms