Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DMDP11532 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DMDP11532 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DMDP11532 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DMDP11532 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DMDP11532 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DMDP11532 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DMDP11532 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DMDP11532 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DMDP11532 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DMDP11532 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DMDP11532 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DMDP11532 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DMDP11532 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DMDP11532 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DMDP11532 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DMDP11532 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DMDP11532 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DMDP11532 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DMDP11532 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DMDP11532 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DMDP11532 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DMDP11532 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DMDP11532 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DMDP11532 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DMDP11532 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DMDP11532 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DMDP11532 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
DMDP11532 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DMDP11532 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DMDP11532 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DMDP11532 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DMDP11532 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DMDP11532 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DMDP11532 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DMDP11532 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
DMDP11532 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DMDP11532 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DMDP11532 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DMDP11532 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DMDP11532 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DMDP11532 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DMDP11532 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DMDP11532 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DMDP11532 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DMDP11532 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DMDP11532 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DMDP11532 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DMDP11532 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DMDP11532 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DMDP11532 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DMDP11532 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DMDP11532 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DMDP11532 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DMDP11532 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DMDP11532 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DMDP11532 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DMDP11532 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DMDP11532 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DMDP11532 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DMDP11532 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DMDP11532 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DMDP11532 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DMDP11532 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DMDP11532 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DMDP11532 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DMDP11532 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DMDP11532 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DMDP11532 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DMDP11532 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DMDP11532 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DMDP11532 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DMDP11532 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DMDP11532 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DMDP11532 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DMDP11532 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DMDP11532 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
DMDP11532 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.31
DMDP11532 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DMDP11532 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DMDP11532 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DMDP11532 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DMDP11532 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DMDP11532 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DMDP11532 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DMDP11532 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DMDP11532 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DMDP11532 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DMDP11532 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DMDP11532 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DMDP11532 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DMDP11532 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DMDP11532 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DMDP11532 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DMDP11532 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DMDP11532 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DMDP11532 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DMDP11532 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DMDP11532 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DMDP11532 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms