Protein–RNA interactions for Protein: P09012

SNRPA, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPAP09012 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SNRPAP09012 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SNRPAP09012 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPAP09012 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms