Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PKHD1P08F94 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PKHD1P08F94 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKHD1P08F94 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PKHD1P08F94 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKHD1P08F94 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKHD1P08F94 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PKHD1P08F94 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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