Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOL3O95236 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOL3O95236 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOL3O95236 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
APOL3O95236 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOL3O95236 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOL3O95236 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOL3O95236 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOL3O95236 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOL3O95236 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOL3O95236 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOL3O95236 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOL3O95236 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOL3O95236 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOL3O95236 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOL3O95236 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOL3O95236 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOL3O95236 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOL3O95236 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOL3O95236 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOL3O95236 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOL3O95236 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOL3O95236 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOL3O95236 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
APOL3O95236 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOL3O95236 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOL3O95236 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOL3O95236 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOL3O95236 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOL3O95236 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOL3O95236 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOL3O95236 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOL3O95236 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOL3O95236 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOL3O95236 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOL3O95236 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOL3O95236 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOL3O95236 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOL3O95236 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOL3O95236 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
APOL3O95236 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOL3O95236 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOL3O95236 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOL3O95236 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOL3O95236 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOL3O95236 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOL3O95236 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOL3O95236 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOL3O95236 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOL3O95236 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOL3O95236 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOL3O95236 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOL3O95236 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOL3O95236 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOL3O95236 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOL3O95236 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOL3O95236 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOL3O95236 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOL3O95236 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOL3O95236 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOL3O95236 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOL3O95236 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOL3O95236 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOL3O95236 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOL3O95236 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOL3O95236 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOL3O95236 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOL3O95236 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOL3O95236 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOL3O95236 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOL3O95236 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOL3O95236 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOL3O95236 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOL3O95236 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOL3O95236 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOL3O95236 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOL3O95236 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOL3O95236 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOL3O95236 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOL3O95236 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
APOL3O95236 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOL3O95236 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOL3O95236 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOL3O95236 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOL3O95236 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOL3O95236 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOL3O95236 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
APOL3O95236 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOL3O95236 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOL3O95236 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOL3O95236 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOL3O95236 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOL3O95236 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOL3O95236 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOL3O95236 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOL3O95236 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOL3O95236 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOL3O95236 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOL3O95236 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
APOL3O95236 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms