Protein–RNA interactions for Protein: O75626

PRDM1, PR domain zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM1O75626 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM1O75626 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM1O75626 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PRDM1O75626 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRDM1O75626 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
PRDM1O75626 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PRDM1O75626 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRDM1O75626 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.4 ms