Protein–RNA interactions for Protein: O60341

KDM1A, Lysine-specific histone demethylase 1A, humanhuman

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1AO60341 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KDM1AO60341 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KDM1AO60341 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms