Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DENRO43583 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DENRO43583 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DENRO43583 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DENRO43583 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DENRO43583 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DENRO43583 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DENRO43583 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DENRO43583 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DENRO43583 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DENRO43583 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DENRO43583 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DENRO43583 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DENRO43583 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DENRO43583 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DENRO43583 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DENRO43583 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DENRO43583 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DENRO43583 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DENRO43583 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DENRO43583 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DENRO43583 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DENRO43583 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DENRO43583 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DENRO43583 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DENRO43583 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DENRO43583 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DENRO43583 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DENRO43583 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DENRO43583 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DENRO43583 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DENRO43583 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DENRO43583 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DENRO43583 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DENRO43583 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DENRO43583 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DENRO43583 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DENRO43583 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DENRO43583 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DENRO43583 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DENRO43583 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DENRO43583 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DENRO43583 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DENRO43583 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DENRO43583 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DENRO43583 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DENRO43583 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DENRO43583 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DENRO43583 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DENRO43583 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DENRO43583 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DENRO43583 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DENRO43583 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DENRO43583 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DENRO43583 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DENRO43583 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
DENRO43583 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DENRO43583 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
DENRO43583 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DENRO43583 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DENRO43583 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DENRO43583 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DENRO43583 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DENRO43583 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DENRO43583 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DENRO43583 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DENRO43583 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DENRO43583 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DENRO43583 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DENRO43583 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DENRO43583 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DENRO43583 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DENRO43583 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DENRO43583 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DENRO43583 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DENRO43583 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DENRO43583 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DENRO43583 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DENRO43583 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DENRO43583 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DENRO43583 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DENRO43583 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DENRO43583 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DENRO43583 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DENRO43583 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DENRO43583 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DENRO43583 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DENRO43583 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DENRO43583 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DENRO43583 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DENRO43583 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DENRO43583 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DENRO43583 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DENRO43583 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DENRO43583 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DENRO43583 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DENRO43583 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DENRO43583 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DENRO43583 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DENRO43583 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.1 ms