Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HTRA2O43464 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTRA2O43464 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTRA2O43464 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTRA2O43464 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA2O43464 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA2O43464 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA2O43464 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA2O43464 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA2O43464 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA2O43464 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA2O43464 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA2O43464 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA2O43464 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA2O43464 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA2O43464 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA2O43464 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTRA2O43464 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTRA2O43464 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HTRA2O43464 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTRA2O43464 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTRA2O43464 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTRA2O43464 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTRA2O43464 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTRA2O43464 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTRA2O43464 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HTRA2O43464 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTRA2O43464 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTRA2O43464 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTRA2O43464 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTRA2O43464 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTRA2O43464 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTRA2O43464 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTRA2O43464 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTRA2O43464 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTRA2O43464 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTRA2O43464 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTRA2O43464 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HTRA2O43464 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTRA2O43464 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTRA2O43464 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTRA2O43464 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTRA2O43464 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTRA2O43464 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.6 ms