Protein–RNA interactions for Protein: H3BP13

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LH3BP13 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TRAPPC2LH3BP13 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAPPC2LH3BP13 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.3 ms