Protein–RNA interactions for Protein: H3BNX3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNX3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H3BNX3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H3BNX3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H3BNX3 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H3BNX3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H3BNX3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H3BNX3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
H3BNX3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
H3BNX3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H3BNX3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H3BNX3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H3BNX3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H3BNX3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
H3BNX3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H3BNX3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H3BNX3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H3BNX3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
H3BNX3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H3BNX3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H3BNX3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H3BNX3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H3BNX3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H3BNX3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H3BNX3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H3BNX3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H3BNX3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H3BNX3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H3BNX3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
H3BNX3 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
H3BNX3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H3BNX3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H3BNX3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H3BNX3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H3BNX3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H3BNX3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H3BNX3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
H3BNX3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H3BNX3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H3BNX3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H3BNX3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H3BNX3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H3BNX3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H3BNX3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
H3BNX3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
H3BNX3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
H3BNX3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
H3BNX3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
H3BNX3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H3BNX3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H3BNX3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
H3BNX3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H3BNX3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H3BNX3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
H3BNX3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
H3BNX3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
H3BNX3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H3BNX3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H3BNX3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
H3BNX3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H3BNX3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H3BNX3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H3BNX3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H3BNX3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H3BNX3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H3BNX3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H3BNX3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
H3BNX3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H3BNX3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H3BNX3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
H3BNX3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3BNX3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3BNX3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3BNX3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3BNX3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H3BNX3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BNX3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BNX3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BNX3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BNX3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BNX3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BNX3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BNX3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H3BNX3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H3BNX3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H3BNX3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H3BNX3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
H3BNX3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H3BNX3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H3BNX3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H3BNX3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
H3BNX3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H3BNX3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H3BNX3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H3BNX3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
H3BNX3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
H3BNX3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H3BNX3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H3BNX3 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H3BNX3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H3BNX3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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