Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC01549A6NIU2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC01549A6NIU2 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms