Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU0

FAM187A, Ig-like V-type domain-containing protein FAM187A, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187AA6NFU0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM187AA6NFU0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM187AA6NFU0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM187AA6NFU0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM187AA6NFU0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM187AA6NFU0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM187AA6NFU0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM187AA6NFU0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM187AA6NFU0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM187AA6NFU0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM187AA6NFU0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM187AA6NFU0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM187AA6NFU0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM187AA6NFU0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM187AA6NFU0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM187AA6NFU0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM187AA6NFU0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM187AA6NFU0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM187AA6NFU0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FAM187AA6NFU0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FAM187AA6NFU0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FAM187AA6NFU0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FAM187AA6NFU0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FAM187AA6NFU0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FAM187AA6NFU0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM187AA6NFU0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM187AA6NFU0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM187AA6NFU0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM187AA6NFU0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM187AA6NFU0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FAM187AA6NFU0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM187AA6NFU0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM187AA6NFU0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM187AA6NFU0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM187AA6NFU0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM187AA6NFU0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM187AA6NFU0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM187AA6NFU0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM187AA6NFU0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM187AA6NFU0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM187AA6NFU0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM187AA6NFU0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM187AA6NFU0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM187AA6NFU0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM187AA6NFU0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM187AA6NFU0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM187AA6NFU0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms