Protein–RNA interactions for Protein: A6NED2

RCCD1, RCC1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1A6NED2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
RCCD1A6NED2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RCCD1A6NED2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RCCD1A6NED2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms