Protein–RNA interactions for Protein: R4GMQ9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R4GMQ9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
R4GMQ9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
R4GMQ9 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
R4GMQ9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
R4GMQ9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
R4GMQ9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
R4GMQ9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
R4GMQ9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
R4GMQ9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
R4GMQ9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
R4GMQ9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
R4GMQ9 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
R4GMQ9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
R4GMQ9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
R4GMQ9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
R4GMQ9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
R4GMQ9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
R4GMQ9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
R4GMQ9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
R4GMQ9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
R4GMQ9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
R4GMQ9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
R4GMQ9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
R4GMQ9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
R4GMQ9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
R4GMQ9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
R4GMQ9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
R4GMQ9 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
R4GMQ9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
R4GMQ9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
R4GMQ9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
R4GMQ9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
R4GMQ9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
R4GMQ9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
R4GMQ9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
R4GMQ9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
R4GMQ9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
R4GMQ9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
R4GMQ9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
R4GMQ9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
R4GMQ9 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
R4GMQ9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
R4GMQ9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
R4GMQ9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
R4GMQ9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
R4GMQ9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
R4GMQ9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
R4GMQ9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
R4GMQ9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
R4GMQ9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
R4GMQ9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
R4GMQ9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
R4GMQ9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
R4GMQ9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
R4GMQ9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
R4GMQ9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
R4GMQ9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
R4GMQ9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
R4GMQ9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
R4GMQ9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
R4GMQ9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
R4GMQ9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
R4GMQ9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
R4GMQ9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
R4GMQ9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
R4GMQ9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
R4GMQ9 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
R4GMQ9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
R4GMQ9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
R4GMQ9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
R4GMQ9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
R4GMQ9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
R4GMQ9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
R4GMQ9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
R4GMQ9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
R4GMQ9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
R4GMQ9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
R4GMQ9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
R4GMQ9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
R4GMQ9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
R4GMQ9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
R4GMQ9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
R4GMQ9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
R4GMQ9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
R4GMQ9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
R4GMQ9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
R4GMQ9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
R4GMQ9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
R4GMQ9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
R4GMQ9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
R4GMQ9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
R4GMQ9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
R4GMQ9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
R4GMQ9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
R4GMQ9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
R4GMQ9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
R4GMQ9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
R4GMQ9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
R4GMQ9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
R4GMQ9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms