Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARFGEF1Q9Y6D6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARFGEF1Q9Y6D6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARFGEF1Q9Y6D6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARFGEF1Q9Y6D6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARFGEF1Q9Y6D6 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARFGEF1Q9Y6D6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ARFGEF1Q9Y6D6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARFGEF1Q9Y6D6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARFGEF1Q9Y6D6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARFGEF1Q9Y6D6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARFGEF1Q9Y6D6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARFGEF1Q9Y6D6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARFGEF1Q9Y6D6 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ARFGEF1Q9Y6D6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
ARFGEF1Q9Y6D6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ARFGEF1Q9Y6D6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARFGEF1Q9Y6D6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARFGEF1Q9Y6D6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARFGEF1Q9Y6D6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARFGEF1Q9Y6D6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ARFGEF1Q9Y6D6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
ARFGEF1Q9Y6D6 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ARFGEF1Q9Y6D6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARFGEF1Q9Y6D6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ARFGEF1Q9Y6D6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ARFGEF1Q9Y6D6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARFGEF1Q9Y6D6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ARFGEF1Q9Y6D6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ARFGEF1Q9Y6D6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ARFGEF1Q9Y6D6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ARFGEF1Q9Y6D6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARFGEF1Q9Y6D6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARFGEF1Q9Y6D6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARFGEF1Q9Y6D6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARFGEF1Q9Y6D6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARFGEF1Q9Y6D6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARFGEF1Q9Y6D6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ARFGEF1Q9Y6D6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARFGEF1Q9Y6D6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARFGEF1Q9Y6D6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARFGEF1Q9Y6D6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARFGEF1Q9Y6D6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARFGEF1Q9Y6D6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARFGEF1Q9Y6D6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARFGEF1Q9Y6D6 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARFGEF1Q9Y6D6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ARFGEF1Q9Y6D6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARFGEF1Q9Y6D6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARFGEF1Q9Y6D6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARFGEF1Q9Y6D6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms