Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4G8

RAPGEF2, Rap guanine nucleotide exchange factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF2Q9Y4G8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
RAPGEF2Q9Y4G8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
RAPGEF2Q9Y4G8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
RAPGEF2Q9Y4G8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
RAPGEF2Q9Y4G8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
RAPGEF2Q9Y4G8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
RAPGEF2Q9Y4G8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
RAPGEF2Q9Y4G8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
RAPGEF2Q9Y4G8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
RAPGEF2Q9Y4G8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
RAPGEF2Q9Y4G8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
RAPGEF2Q9Y4G8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
RAPGEF2Q9Y4G8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.75
RAPGEF2Q9Y4G8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.75
RAPGEF2Q9Y4G8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC38.5■■■■□ 3.75
RAPGEF2Q9Y4G8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
RAPGEF2Q9Y4G8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
RAPGEF2Q9Y4G8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
RAPGEF2Q9Y4G8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
RAPGEF2Q9Y4G8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
RAPGEF2Q9Y4G8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
RAPGEF2Q9Y4G8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
RAPGEF2Q9Y4G8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
RAPGEF2Q9Y4G8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
RAPGEF2Q9Y4G8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
RAPGEF2Q9Y4G8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
RAPGEF2Q9Y4G8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
RAPGEF2Q9Y4G8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
RAPGEF2Q9Y4G8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
RAPGEF2Q9Y4G8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
RAPGEF2Q9Y4G8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
RAPGEF2Q9Y4G8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
RAPGEF2Q9Y4G8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
RAPGEF2Q9Y4G8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
RAPGEF2Q9Y4G8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
RAPGEF2Q9Y4G8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
RAPGEF2Q9Y4G8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
RAPGEF2Q9Y4G8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
RAPGEF2Q9Y4G8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
RAPGEF2Q9Y4G8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
RAPGEF2Q9Y4G8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
RAPGEF2Q9Y4G8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
RAPGEF2Q9Y4G8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
RAPGEF2Q9Y4G8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
RAPGEF2Q9Y4G8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
RAPGEF2Q9Y4G8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
RAPGEF2Q9Y4G8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
RAPGEF2Q9Y4G8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
RAPGEF2Q9Y4G8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
RAPGEF2Q9Y4G8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
RAPGEF2Q9Y4G8 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
RAPGEF2Q9Y4G8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
RAPGEF2Q9Y4G8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
RAPGEF2Q9Y4G8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
RAPGEF2Q9Y4G8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
RAPGEF2Q9Y4G8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
RAPGEF2Q9Y4G8 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
RAPGEF2Q9Y4G8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
RAPGEF2Q9Y4G8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
RAPGEF2Q9Y4G8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
RAPGEF2Q9Y4G8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC38.41■■■■□ 3.74
RAPGEF2Q9Y4G8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
RAPGEF2Q9Y4G8 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
RAPGEF2Q9Y4G8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
RAPGEF2Q9Y4G8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
RAPGEF2Q9Y4G8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
RAPGEF2Q9Y4G8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
RAPGEF2Q9Y4G8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
RAPGEF2Q9Y4G8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
RAPGEF2Q9Y4G8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
RAPGEF2Q9Y4G8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
RAPGEF2Q9Y4G8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
RAPGEF2Q9Y4G8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
RAPGEF2Q9Y4G8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
RAPGEF2Q9Y4G8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
RAPGEF2Q9Y4G8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
RAPGEF2Q9Y4G8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
RAPGEF2Q9Y4G8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
RAPGEF2Q9Y4G8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
RAPGEF2Q9Y4G8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
RAPGEF2Q9Y4G8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
RAPGEF2Q9Y4G8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
RAPGEF2Q9Y4G8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
RAPGEF2Q9Y4G8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
RAPGEF2Q9Y4G8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
RAPGEF2Q9Y4G8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
RAPGEF2Q9Y4G8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
RAPGEF2Q9Y4G8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
RAPGEF2Q9Y4G8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
RAPGEF2Q9Y4G8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
RAPGEF2Q9Y4G8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
RAPGEF2Q9Y4G8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
RAPGEF2Q9Y4G8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
RAPGEF2Q9Y4G8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
RAPGEF2Q9Y4G8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
RAPGEF2Q9Y4G8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
RAPGEF2Q9Y4G8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
RAPGEF2Q9Y4G8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
RAPGEF2Q9Y4G8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
RAPGEF2Q9Y4G8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms