Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDHA12Q9UN75 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDHA12Q9UN75 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDHA12Q9UN75 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PCDHA12Q9UN75 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCDHA12Q9UN75 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCDHA12Q9UN75 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCDHA12Q9UN75 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCDHA12Q9UN75 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCDHA12Q9UN75 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PCDHA12Q9UN75 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCDHA12Q9UN75 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCDHA12Q9UN75 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCDHA12Q9UN75 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCDHA12Q9UN75 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCDHA12Q9UN75 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PCDHA12Q9UN75 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCDHA12Q9UN75 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCDHA12Q9UN75 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCDHA12Q9UN75 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCDHA12Q9UN75 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PCDHA12Q9UN75 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCDHA12Q9UN75 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCDHA12Q9UN75 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCDHA12Q9UN75 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCDHA12Q9UN75 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCDHA12Q9UN75 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCDHA12Q9UN75 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCDHA12Q9UN75 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCDHA12Q9UN75 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCDHA12Q9UN75 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCDHA12Q9UN75 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCDHA12Q9UN75 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCDHA12Q9UN75 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCDHA12Q9UN75 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCDHA12Q9UN75 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PCDHA12Q9UN75 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCDHA12Q9UN75 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCDHA12Q9UN75 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCDHA12Q9UN75 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCDHA12Q9UN75 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCDHA12Q9UN75 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PCDHA12Q9UN75 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCDHA12Q9UN75 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCDHA12Q9UN75 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCDHA12Q9UN75 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCDHA12Q9UN75 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCDHA12Q9UN75 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCDHA12Q9UN75 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCDHA12Q9UN75 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCDHA12Q9UN75 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCDHA12Q9UN75 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCDHA12Q9UN75 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCDHA12Q9UN75 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCDHA12Q9UN75 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCDHA12Q9UN75 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCDHA12Q9UN75 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCDHA12Q9UN75 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCDHA12Q9UN75 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCDHA12Q9UN75 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCDHA12Q9UN75 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCDHA12Q9UN75 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCDHA12Q9UN75 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCDHA12Q9UN75 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms