Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULN7

PNMA8B, Paraneoplastic antigen-like protein 8B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8BQ9ULN7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PNMA8BQ9ULN7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PNMA8BQ9ULN7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA8BQ9ULN7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA8BQ9ULN7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA8BQ9ULN7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA8BQ9ULN7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA8BQ9ULN7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA8BQ9ULN7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA8BQ9ULN7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA8BQ9ULN7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PNMA8BQ9ULN7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA8BQ9ULN7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA8BQ9ULN7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA8BQ9ULN7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA8BQ9ULN7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA8BQ9ULN7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PNMA8BQ9ULN7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA8BQ9ULN7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA8BQ9ULN7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA8BQ9ULN7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA8BQ9ULN7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA8BQ9ULN7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PNMA8BQ9ULN7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA8BQ9ULN7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA8BQ9ULN7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA8BQ9ULN7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA8BQ9ULN7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA8BQ9ULN7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PNMA8BQ9ULN7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA8BQ9ULN7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA8BQ9ULN7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA8BQ9ULN7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA8BQ9ULN7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA8BQ9ULN7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PNMA8BQ9ULN7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms