Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRPF3Q9ULD4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRPF3Q9ULD4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRPF3Q9ULD4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRPF3Q9ULD4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRPF3Q9ULD4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BRPF3Q9ULD4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRPF3Q9ULD4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRPF3Q9ULD4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRPF3Q9ULD4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRPF3Q9ULD4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRPF3Q9ULD4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
BRPF3Q9ULD4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRPF3Q9ULD4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRPF3Q9ULD4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRPF3Q9ULD4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRPF3Q9ULD4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BRPF3Q9ULD4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRPF3Q9ULD4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRPF3Q9ULD4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRPF3Q9ULD4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRPF3Q9ULD4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRPF3Q9ULD4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRPF3Q9ULD4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRPF3Q9ULD4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
BRPF3Q9ULD4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BRPF3Q9ULD4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRPF3Q9ULD4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRPF3Q9ULD4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRPF3Q9ULD4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
BRPF3Q9ULD4 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRPF3Q9ULD4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BRPF3Q9ULD4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRPF3Q9ULD4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRPF3Q9ULD4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
BRPF3Q9ULD4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRPF3Q9ULD4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRPF3Q9ULD4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRPF3Q9ULD4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
BRPF3Q9ULD4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRPF3Q9ULD4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BRPF3Q9ULD4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BRPF3Q9ULD4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRPF3Q9ULD4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRPF3Q9ULD4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
BRPF3Q9ULD4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRPF3Q9ULD4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRPF3Q9ULD4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRPF3Q9ULD4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRPF3Q9ULD4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRPF3Q9ULD4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRPF3Q9ULD4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRPF3Q9ULD4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRPF3Q9ULD4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
BRPF3Q9ULD4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRPF3Q9ULD4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRPF3Q9ULD4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms