Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PNMA2Q9UL42 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PNMA2Q9UL42 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PNMA2Q9UL42 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PNMA2Q9UL42 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PNMA2Q9UL42 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PNMA2Q9UL42 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PNMA2Q9UL42 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PNMA2Q9UL42 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PNMA2Q9UL42 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PNMA2Q9UL42 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNMA2Q9UL42 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNMA2Q9UL42 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNMA2Q9UL42 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNMA2Q9UL42 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PNMA2Q9UL42 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PNMA2Q9UL42 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PNMA2Q9UL42 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PNMA2Q9UL42 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PNMA2Q9UL42 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PNMA2Q9UL42 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PNMA2Q9UL42 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PNMA2Q9UL42 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PNMA2Q9UL42 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PNMA2Q9UL42 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PNMA2Q9UL42 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PNMA2Q9UL42 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PNMA2Q9UL42 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PNMA2Q9UL42 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PNMA2Q9UL42 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PNMA2Q9UL42 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PNMA2Q9UL42 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PNMA2Q9UL42 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PNMA2Q9UL42 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PNMA2Q9UL42 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PNMA2Q9UL42 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PNMA2Q9UL42 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PNMA2Q9UL42 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PNMA2Q9UL42 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PNMA2Q9UL42 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PNMA2Q9UL42 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PNMA2Q9UL42 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PNMA2Q9UL42 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PNMA2Q9UL42 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PNMA2Q9UL42 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PNMA2Q9UL42 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PNMA2Q9UL42 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PNMA2Q9UL42 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PNMA2Q9UL42 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PNMA2Q9UL42 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PNMA2Q9UL42 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PNMA2Q9UL42 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PNMA2Q9UL42 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PNMA2Q9UL42 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PNMA2Q9UL42 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PNMA2Q9UL42 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PNMA2Q9UL42 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PNMA2Q9UL42 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PNMA2Q9UL42 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PNMA2Q9UL42 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PNMA2Q9UL42 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PNMA2Q9UL42 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PNMA2Q9UL42 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PNMA2Q9UL42 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PNMA2Q9UL42 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PNMA2Q9UL42 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PNMA2Q9UL42 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PNMA2Q9UL42 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PNMA2Q9UL42 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PNMA2Q9UL42 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PNMA2Q9UL42 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PNMA2Q9UL42 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PNMA2Q9UL42 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PNMA2Q9UL42 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PNMA2Q9UL42 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PNMA2Q9UL42 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PNMA2Q9UL42 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PNMA2Q9UL42 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PNMA2Q9UL42 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PNMA2Q9UL42 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PNMA2Q9UL42 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PNMA2Q9UL42 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PNMA2Q9UL42 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PNMA2Q9UL42 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PNMA2Q9UL42 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PNMA2Q9UL42 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PNMA2Q9UL42 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PNMA2Q9UL42 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PNMA2Q9UL42 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PNMA2Q9UL42 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PNMA2Q9UL42 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PNMA2Q9UL42 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PNMA2Q9UL42 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PNMA2Q9UL42 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PNMA2Q9UL42 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PNMA2Q9UL42 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PNMA2Q9UL42 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PNMA2Q9UL42 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PNMA2Q9UL42 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PNMA2Q9UL42 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms