Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKU0

ACSL6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSL6Q9UKU0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACSL6Q9UKU0 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ACSL6Q9UKU0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms