Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
TNIKQ9UKE5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
TNIKQ9UKE5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
TNIKQ9UKE5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
TNIKQ9UKE5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
TNIKQ9UKE5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
TNIKQ9UKE5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
TNIKQ9UKE5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
TNIKQ9UKE5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
TNIKQ9UKE5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
TNIKQ9UKE5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
TNIKQ9UKE5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
TNIKQ9UKE5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
TNIKQ9UKE5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
TNIKQ9UKE5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
TNIKQ9UKE5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
TNIKQ9UKE5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
TNIKQ9UKE5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
TNIKQ9UKE5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC38.39■■■■□ 3.74
TNIKQ9UKE5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
TNIKQ9UKE5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
TNIKQ9UKE5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
TNIKQ9UKE5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC38.38■■■■□ 3.73
TNIKQ9UKE5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
TNIKQ9UKE5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
TNIKQ9UKE5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
TNIKQ9UKE5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
TNIKQ9UKE5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
TNIKQ9UKE5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC38.37■■■■□ 3.73
TNIKQ9UKE5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
TNIKQ9UKE5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
TNIKQ9UKE5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
TNIKQ9UKE5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
TNIKQ9UKE5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
TNIKQ9UKE5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TNIKQ9UKE5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
TNIKQ9UKE5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
TNIKQ9UKE5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
TNIKQ9UKE5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
TNIKQ9UKE5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
TNIKQ9UKE5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
TNIKQ9UKE5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.34■■■■□ 3.73
TNIKQ9UKE5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
TNIKQ9UKE5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
TNIKQ9UKE5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
TNIKQ9UKE5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
TNIKQ9UKE5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
TNIKQ9UKE5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
TNIKQ9UKE5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
TNIKQ9UKE5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
TNIKQ9UKE5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
TNIKQ9UKE5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
TNIKQ9UKE5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
TNIKQ9UKE5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
TNIKQ9UKE5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
TNIKQ9UKE5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
TNIKQ9UKE5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
TNIKQ9UKE5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
TNIKQ9UKE5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC38.29■■■■□ 3.72
TNIKQ9UKE5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
TNIKQ9UKE5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
TNIKQ9UKE5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
TNIKQ9UKE5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
TNIKQ9UKE5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
TNIKQ9UKE5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
TNIKQ9UKE5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
TNIKQ9UKE5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
TNIKQ9UKE5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
TNIKQ9UKE5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
TNIKQ9UKE5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
TNIKQ9UKE5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
TNIKQ9UKE5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
TNIKQ9UKE5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
TNIKQ9UKE5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
TNIKQ9UKE5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.71
TNIKQ9UKE5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC38.26■■■■□ 3.71
TNIKQ9UKE5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
TNIKQ9UKE5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
TNIKQ9UKE5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
TNIKQ9UKE5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
TNIKQ9UKE5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
TNIKQ9UKE5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
TNIKQ9UKE5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
TNIKQ9UKE5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
TNIKQ9UKE5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
TNIKQ9UKE5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
TNIKQ9UKE5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
TNIKQ9UKE5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
TNIKQ9UKE5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
TNIKQ9UKE5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
TNIKQ9UKE5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC38.22■■■■□ 3.71
TNIKQ9UKE5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
TNIKQ9UKE5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
TNIKQ9UKE5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
TNIKQ9UKE5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
TNIKQ9UKE5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
TNIKQ9UKE5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
TNIKQ9UKE5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
TNIKQ9UKE5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
TNIKQ9UKE5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms