Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SCP2D1Q9UJQ7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCP2D1Q9UJQ7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCP2D1Q9UJQ7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SCP2D1Q9UJQ7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCP2D1Q9UJQ7 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCP2D1Q9UJQ7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCP2D1Q9UJQ7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCP2D1Q9UJQ7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCP2D1Q9UJQ7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCP2D1Q9UJQ7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCP2D1Q9UJQ7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCP2D1Q9UJQ7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCP2D1Q9UJQ7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCP2D1Q9UJQ7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCP2D1Q9UJQ7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCP2D1Q9UJQ7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SCP2D1Q9UJQ7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCP2D1Q9UJQ7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCP2D1Q9UJQ7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SCP2D1Q9UJQ7 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCP2D1Q9UJQ7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCP2D1Q9UJQ7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCP2D1Q9UJQ7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCP2D1Q9UJQ7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCP2D1Q9UJQ7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCP2D1Q9UJQ7 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCP2D1Q9UJQ7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCP2D1Q9UJQ7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCP2D1Q9UJQ7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCP2D1Q9UJQ7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms