Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTSFQ9UBX1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTSFQ9UBX1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTSFQ9UBX1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms