Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHD7Q9P2D1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHD7Q9P2D1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHD7Q9P2D1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHD7Q9P2D1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHD7Q9P2D1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHD7Q9P2D1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHD7Q9P2D1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHD7Q9P2D1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHD7Q9P2D1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHD7Q9P2D1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHD7Q9P2D1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHD7Q9P2D1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHD7Q9P2D1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHD7Q9P2D1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHD7Q9P2D1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHD7Q9P2D1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHD7Q9P2D1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHD7Q9P2D1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHD7Q9P2D1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHD7Q9P2D1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CHD7Q9P2D1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHD7Q9P2D1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CHD7Q9P2D1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHD7Q9P2D1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHD7Q9P2D1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHD7Q9P2D1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CHD7Q9P2D1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHD7Q9P2D1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHD7Q9P2D1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHD7Q9P2D1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CHD7Q9P2D1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHD7Q9P2D1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHD7Q9P2D1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.6 ms