Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYC9

DNAH9, Dynein heavy chain 9, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 4,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAH9Q9NYC9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DNAH9Q9NYC9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNAH9Q9NYC9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DNAH9Q9NYC9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAH9Q9NYC9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAH9Q9NYC9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAH9Q9NYC9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAH9Q9NYC9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAH9Q9NYC9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAH9Q9NYC9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAH9Q9NYC9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DNAH9Q9NYC9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DNAH9Q9NYC9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DNAH9Q9NYC9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DNAH9Q9NYC9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DNAH9Q9NYC9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DNAH9Q9NYC9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DNAH9Q9NYC9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DNAH9Q9NYC9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DNAH9Q9NYC9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DNAH9Q9NYC9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DNAH9Q9NYC9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DNAH9Q9NYC9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DNAH9Q9NYC9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DNAH9Q9NYC9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAH9Q9NYC9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAH9Q9NYC9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAH9Q9NYC9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAH9Q9NYC9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAH9Q9NYC9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAH9Q9NYC9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAH9Q9NYC9 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAH9Q9NYC9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAH9Q9NYC9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAH9Q9NYC9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
DNAH9Q9NYC9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAH9Q9NYC9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAH9Q9NYC9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAH9Q9NYC9 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAH9Q9NYC9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAH9Q9NYC9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAH9Q9NYC9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAH9Q9NYC9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAH9Q9NYC9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAH9Q9NYC9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAH9Q9NYC9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAH9Q9NYC9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAH9Q9NYC9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAH9Q9NYC9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAH9Q9NYC9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAH9Q9NYC9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAH9Q9NYC9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
DNAH9Q9NYC9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms