Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRMT1Q9NXH9 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TRMT1Q9NXH9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TRMT1Q9NXH9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRMT1Q9NXH9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRMT1Q9NXH9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRMT1Q9NXH9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRMT1Q9NXH9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRMT1Q9NXH9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRMT1Q9NXH9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRMT1Q9NXH9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRMT1Q9NXH9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRMT1Q9NXH9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRMT1Q9NXH9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRMT1Q9NXH9 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRMT1Q9NXH9 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRMT1Q9NXH9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRMT1Q9NXH9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TRMT1Q9NXH9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRMT1Q9NXH9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRMT1Q9NXH9 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRMT1Q9NXH9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRMT1Q9NXH9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRMT1Q9NXH9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRMT1Q9NXH9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRMT1Q9NXH9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRMT1Q9NXH9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRMT1Q9NXH9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRMT1Q9NXH9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRMT1Q9NXH9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRMT1Q9NXH9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRMT1Q9NXH9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRMT1Q9NXH9 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRMT1Q9NXH9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRMT1Q9NXH9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRMT1Q9NXH9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TRMT1Q9NXH9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRMT1Q9NXH9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRMT1Q9NXH9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TRMT1Q9NXH9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms