Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAPOLBQ9NRJ5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PAPOLBQ9NRJ5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PAPOLBQ9NRJ5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms