Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
XPNPEP3Q9NQH7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
XPNPEP3Q9NQH7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
XPNPEP3Q9NQH7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms