Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9C1

VIPAS39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIPAS39Q9H9C1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VIPAS39Q9H9C1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VIPAS39Q9H9C1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms