Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8X3

LINC00574, Putative uncharacterized protein LINC00574, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00574Q9H8X3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00574Q9H8X3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00574Q9H8X3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00574Q9H8X3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00574Q9H8X3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00574Q9H8X3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00574Q9H8X3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00574Q9H8X3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00574Q9H8X3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00574Q9H8X3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00574Q9H8X3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00574Q9H8X3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00574Q9H8X3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00574Q9H8X3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00574Q9H8X3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00574Q9H8X3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00574Q9H8X3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00574Q9H8X3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00574Q9H8X3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00574Q9H8X3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00574Q9H8X3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00574Q9H8X3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00574Q9H8X3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00574Q9H8X3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00574Q9H8X3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00574Q9H8X3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00574Q9H8X3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00574Q9H8X3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00574Q9H8X3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00574Q9H8X3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00574Q9H8X3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00574Q9H8X3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00574Q9H8X3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00574Q9H8X3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00574Q9H8X3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LINC00574Q9H8X3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LINC00574Q9H8X3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
LINC00574Q9H8X3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00574Q9H8X3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00574Q9H8X3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
LINC00574Q9H8X3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms