Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8W5

TRIM45, Tripartite motif-containing protein 45, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM45Q9H8W5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRIM45Q9H8W5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM45Q9H8W5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM45Q9H8W5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms